益生菌主要具有以下几种生理功能：
一是调节胃肠道失调。益生菌对腹泻、便秘等肠道疾病感染及其并发症, 具有预防和治疗作用;对溃疡性结肠炎、肠易激综合征等有辅助治疗作用。
二是增强肠道免疫功能。益生菌对免疫应答的功效已得到了广泛研究，体外实验、动物实验和临床研究认为，益生菌可以同时促进特异性和非特异性免疫。
三是抑制过敏反应。益生菌能调节机体免疫反应、防止过敏性疾病发生、缓解遗传性过敏反应。
益生菌，这一概念最早来源于希腊语，即“对生命有益”(for
life)。联合国粮农组织(FAO)、世界卫生组织(WHO)对益生菌作了定义：益生菌是“通过摄取适当的量、对食用者的身体健康能发挥有效作用的活菌”。它是一种对人体有益的细菌，能够促进有益菌、抑制致病菌的生长，维持肠道菌群的平衡。
