1、概念不一样
消毒是指杀死病原微生物、但不一定能杀死细菌芽孢的方法。
灭菌是采用强烈的理化因素使任何物体内外部的一切微生物永远丧失其生长繁殖能力的措施。
2、方法不一样
消毒有有物理方法，化学方法及生物方法等。如物理消毒法中的机械消毒一般应用肥皂刷洗，流水冲净，可消除手上绝大部分甚至全部细菌，使用多层口罩可防止病原体自呼吸道排出或侵入。应用通风装置过滤器可使手术室、实验室及隔离病室的空气，保护无菌状态。
灭菌有热灭菌法、干热灭菌、湿热灭菌、间歇灭菌、辐射灭菌、渗透压灭菌、化学试剂灭菌等。
3、目的不一样
消毒的目的是防止病原体播散到社会中等。
灭菌，达到无菌保障水平。经过灭菌处理后，未被污染的物品，称无菌物品。经过灭菌处理后，未被污染的区域，称为无菌区域。
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