主要区别有，身形不同、大小不同、尾鳍不同、嘴部不同，具体如下：
一、身形不同
1、锦鲤
锦鲤身体细长，比较像擀面杖。
2、锦鲫
锦鲫身体短而宽，从背脊到腹部的距离比较大，夸张点的话有点像球拍。
二、大小不同
1、锦鲤
同是成年鱼，锦鲤要比锦鲫大很多，锦鲤可以长到1米多。
2、锦鲫
同是成年鱼，锦鲫要比锦鲤小很多，锦鲫长到30公分已算“巨型”了。
三、尾鳍不同
1、锦鲤
一般的锦鲤的尾鳍比较短。
2、锦鲫
锦鲫的尾鳍一般很长、飘逸（特殊情况，也有尾鳍很长的锦鲤的品种和短尾的锦鲫）。
四、嘴部不同
1、锦鲤
锦鲤的嘴朝下，嘴上有两对不一样长的胡须。
2、锦鲫
锦鲫的嘴朝前，嘴上没有胡须。
参考资料来源：百度百科-锦鲫
