深圳市营业执照三证合一办理流程如下：
第1步：填表。商事主体申请人填写“四证”联合申请书，并准备齐相关材料交商事登记部门，由商事登记部门统一受理。实现“一表申请”、“一门受理”。
第2步：审核。商事登记部门审核“四证”联合申请材料。“四证”申请经商事登记部门审核后，视为同时经税务部门、机构代码部门及公安部门审核。
第3步：领证。经商事登记部门审核通过后，商事主体申请人即可到原组织机构代码登记窗口一次领取“四证”，即：营业执照、税务登记证、组织机构代码证和刻章许可证。实现“四证同发”。
第4步：归档。档案原件由商事登记部门保存，档案影像共享给税务部门、机构代码部门及公安部门。实现“档案共享”。
