科研获奖 根据2016年3月研究院官网显示，至2009年，上海生命科学研究院获国家科技奖励12项、地方科技奖励53项、军队科技奖2项。
2014年，上海生科院共获国家、省部委及各类社会力量奖励77项。 国家级获奖 获奖名称 项目 时间国家自然科学奖二等奖 TRPC通道促进神经突触形成机制的研究2014 国家自然科学奖二等奖 水稻重要生理性状的调控机理与分子育种应用基础2014 国家自然科学奖二等奖 DC细胞活化调控与Th细胞分化机制在免疫相关疾病中的研究2013 国家教育部自然科学奖一等奖 东亚人群和混合人群基因组的连锁不平衡研究2012 国家自然科学奖二等奖 水稻复杂数量性状的分子遗传调控机理2012 国家自然科学奖二等奖 胶质细胞新功能的研究2010 国家科技进步奖二等奖真菌杀虫剂产业化及森林害虫持续控制技术2009资料来源： 项目承担 根据2016年3月研究院官网显示，上海生命科学研究院共争取到国家与地方各类科研项目989项。其中973项目10项，重大科学研究计划项目13项，国家重大专项项目59项，863课题165项，国家自然科学基金重点项目51项，重大研究计划项目36项，创新群体9项，中科院创新重大项目7项，中科院重要方向性项目140项等。近三年到帐的科研项目经费达24.5亿元。
2014年，上海生科院共有在研项目,800余,项，其中主持国家重点基础研究发展计划（973计划含重大科学研究计划） 项目26项、承担课题41项，主持（或承担） 中国高技术研究发展计划（,863计划） 课题5项，主持国家科技支撑计划课题4项，主持（或承担） 重大专项17项，主持国家自然科学基金创新研究群体科学基金7项，重点项目51项，面上项目225项，重大研究计划项目39项，重大项目2项，主持中国科学院战略性先导科技专项1项，承担项目6项，科技服务网络计划项目2项，承担国际合作项目56项，新增的253项各类项目合同经费达4.04亿元。
2013年，上海生科院共有在研项目460余项，其中主持国家重点基础研究发展计划（973计划含重大科学研究计划） 项目26项、承担课题57项，主持（或承担） 中国高技术研究发展计划（863计划） 课题5项，主持国家科技支撑计划课题4项，主持（或承担） 重大专项44项，主持国家自然科学基金创新研究群体科学基金5项，重点项目48项，面上项目210 项，承担国家自然科学基金重大研究计划项目32项，承担国家自然科学基金重大项目1项，主持中国科学院战略性先导科技专项1项，承担项目4项，重要方向项目13项，承担国际合作项目51项，新增的230余项，各类项目合同经费52亿元。 论文发表
2014年，上海生命科学研究院发表sci论文867篇（第一署名单位论文386 篇），在cell、nature、science及其系列期刊等高水平杂志上发表论文102篇（第一署名单位论文58篇），申请专利114项，其中国际专利26项，专利授权70项，其中国际专利5项。
2013年，上海生命科学研究院发表sci论文864篇， 其中影响因子大于9分的52篇， 在《细胞》 （cell）、《自然》（nature）、《科学》 （science） 及其系列期刊上发表论文60篇，申请专利128项，其中国际专利28项，专利授权69 项，其中国际专利11项，通过与企业合作和成果转化， 签订合同金额3152万元，到账金额2597万元，其中技术转让和专利许可金额113 万元。 论文发表情况 刊物2004年2005年2006年2007年2008年2009年Science111113Nature121 24Nature系列4751198Cell---4---1--- 2Cell 系列311433EMBO J--- 21---2---PNAS3889613Plant Cell164334合计133121292439资料来源： 《Cell Research》 《Cell Research 》（《细胞研究》）由中国科学院主管，中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所与中国细胞生物学学会共同主办，中国科学院上海生命科学信息中心/生命科学期刊社承办，是一家以全英文形式出版、编辑和发行原创性研究论文、学科综述及快报的国际性学术月刊。 2013年7月30日，据美国汤森路透集团（Thomson Reuters）发布的最新期刊引证报告（2013版）显示，Cell Research（《细胞研究》）影响因子提升至11.981，在SCI收录的185种国际细胞生物学领域期刊中影响因子排名第13位，在同领域亚太地区学术期刊中排名第一。 《Molecular Plant》 《Molecular Plant》（ 《分子植物》）主办单位：中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所和中国植物生理与分子生物学学会，2013年度影响因子为6.605，处于q1水平，在sci收录的196种国际植物科学领域期刊中影响因子排名第8，该杂志在BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY（分子生物学） 同类期刊中的影响因子排名第43位。 《Acta Biochimica etBiophysica Sinica》 《ActabiochimicaetbiophysicaSinica》（《生物化学与生物物理学报》）创刊于2004年，月刊，被PubMed收录，被SCI收录，其研究领域为: 生物化学、生物物理，主办单位为中国科学院上海生命科学研究院和生物化学与细胞生物学研究所，2014年SCI影响因子：2.191。 《Journal of Molecular Cell Biology》 《Journal of Molecular Cell Biology》（ 《分子细胞生物学报》）主办单位为中国科学院上海生命科学研究院、生物化学与细胞生物学研究所、中国细胞生物学学会，2014年SCI影响因子：6.771，2013年度影响因子为8.432， 处于q1水平。 《Neuroscience Bulletin》 《Neuroscience Bulletin》（ 《神经科学通报》）主办单位为中国科学院上海生命科学研究院、中国神经科学学会、第二军医大学，2014年SCI影响因子：2.509。 《Cell Discovery》 《Cell Discovery》主办单位为中国科学院上海生命科学研究院、中国科学院上海生命科学信息中心 、生物化学与细胞生物学研究所、中国细胞生物学学会。 《生理学报》 《生理学报》是由中国生理学会和中国科学院上海生命科学研究院主办、科学出版社出版、中英文兼登的学术刊物，该刊为双月刊，主要刊登生理学和相关生命科学的研究论文、研究快报、实验技术及以本人研究工作为主的综述。该刊的前身是《中国生理学杂志》，于1927年创刊，是中国最早出版的生理学学术期刊。从1953年起，改名为《生理学报》。
《生理学报》被美国“Medline/PubMed”、“Biological Abstracts”、“Chemical Abstracts”、“Index Medicus”、 “BIOSIS Previews”、荷兰“Excerpta Medica”、“Scopus”、波兰“Index Copernicus”、“日本科技文献速报”，“WHO西太平洋地区医学索引”和“俄罗斯文摘”以及“中国科学引文数据库”，中国期刊网等国内外检索期刊或数据库收录，是中国自然科学核心期刊和生物类核心期刊。
《生理学报》在1999年荣获国家期刊界最高奖项——首届“国家期刊奖”；2000年获中国科学院优秀科技期刊特别奖；2001年入选双奖期刊“中国期刊方阵”。2003年荣获第二届“国家期刊奖”。2005年荣获第三届“国家期刊奖百种重点科技期刊”。2009年荣获“新中国60年有影响力的期刊”称号。2005~2012年多次入选“中国百种杰出学术期刊”和“中国精品科技期刊”行列。 《中国细胞生物学学报》 《中国细胞生物学学报》创刊于1979年，由中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所和中国细胞生物学学会共同主办，是国内外公开发行的专业性学术期刊。该刊是北大中文核心期刊、中国科技核心期刊，被中国科技论文与引文数据库（CSTPC）、中国科学引文数据库（CSCD）、中国生物学文摘、中国学术期刊文摘等收录；国际上，被六大检索系统之一的美国化学文摘（CA）收录。同时，该刊被列为中国科学院上海生命科学研究院研究生招生考试的参考书目之一。 《植物生理学报》 《植物生理学报》经新闻出版总署批准，《植物生理学通讯》由2011年更名为《植物生理学报》，英文刊名为Plant Physiology Journal。期刊荣获北京大学图书馆《中文核心期刊要目总览》“植物学类”核心期刊；为中国科学技术信息研究所“中国科技核心期刊”和中科院文献情报中心“中国科学引文数据库来源期刊”；被CA、AJ和JI等收录；入选2012年华东地区优秀期刊。2006～2012年连续7年被评为中国科协精品期刊。 《生命科学》 《生命科学》隶属于中国科学院上海生命科学研究院。1988年创刊，原刊名为《生物学信息》内部发行；1992年起更名为《生命科学》，公开发行，CN31－1600/Q，大16开，96页，是由国家自然科学基金委员会生物科学部、中国科学院前沿科学与教育局、中国科学院生命科学和医学学部和中国科学院上海生命科学研究院共同主办的全国性、公开发行的学术性、综合类期刊。自2004年第1期起，被中国科学技术信息研究所“中国科技论文与引文数据库”收录，即被评为“中国科技核心期刊”。2008年被收录为“中文核心期刊”。
《生命科学》荣获第二届上海市优秀科技期刊评比一等奖。被“中国科技论文与引文数据库”、“中国学术期刊（光盘版）”、“中国期刊网”、“中文科技期刊数据库”、“中国科学引文数据库”、“中国学术期刊综合评价数据库”、“中国生物学文献数据库”、“中国生物医学文献光盘数据库”、“万方数据数字化期刊群”和“台湾华艺CEPS中文电子期刊服务”收录。 《生命的化学》 《生命的化学》创刊于1980年，双月刊，为中国科技核心期刊、中国期刊网来源刊、中文核心期刊（2004版、2008版），已被CA 化学文摘（美）（2011）、JST 日本科学技术振兴机构数据库（日）（2013）、CSCD中国科学引文数据库来源期刊（2013-2014年度）等数据库收录。
