新德里金属－β－内酰胺酶1（简称为NDM－1)
NDM-1是科学家发现的一种新的超级耐药基因，编码一种新的耐药酶，称为NDM-1金属β-内酰胺酶。NDM1是酶菌，肠杆菌的一种，与大肠杆菌（E.coli）、沙门氏菌属同一类（产NDM1型酶的细菌如今发现的是鲍曼不动杆菌，是革兰阴性杆菌，属于非发酵菌，与大肠、沙门、肺炎克雷伯菌等肠杆菌科细）。最近受到媒体广泛关注的所谓超级细菌实际上是一种产新发现的碳青霉烯酶--新德里金属β-内酰胺酶-1(NewDelhimetallo-beta-lactamase-1，NDM-1）的肠杆菌科细菌，产此酶的NDM-1基因（blaNDM-1）常见于大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌及阴沟肠杆菌等，已在南亚发现高度耐药的感染病例，受到医学界高度重视。这种脱氧核糖核酸结构可以在同种甚至异种细菌之间“轻松”复制。研究人员现阶段多在大肠杆菌和肺炎克雷伯氏菌等细菌内发现NDM—1基因。
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（简称为MRSA）
金黄色葡萄球菌是临床上常见的毒性较强的细菌，自从本世纪40年代青霉素问世后，金黄色葡萄球菌引起的感染性疾病受到较大的控制，但随着青霉素的广泛使用，有些金黄色葡萄球菌产生青霉素酶，能水解β-内酰胺环，表现为对青霉素的耐药。因而人们又研究出一种新的能耐青霉素酶的半合成青霉素，即甲氧西林(methicillin)。1959年应用于临床后曾有效地控制了金黄色葡萄球菌产酶株的感染，可时隔两年，英国的Jevons就首次发现了耐甲氧西林金黄色葡萄球菌，MRSA从发现至今感染几乎遍及全球，已成为院内感染的重要病原菌之一。因此，开展对MRSA的检测，对于控制医院内感染的流行，指导临床治疗有着十分重要的意义。
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抗万古霉素肠球菌（简称为VRE）
肠球菌是一种移生在肠道的革兰氏阳性球菌，故名肠球菌。在十九世纪末发现，早期归为链球菌属。1900年代初期，发现肠球菌是引起泌尿道感染及心内膜炎的原因之一。1930年代中期，依Lancefield血清分型，肠球菌被归类为D族链球菌，但是与非肠球菌的D族链球菌，如Streptococcusbovis，在生化特性上有相当的差异性。直到1984年，经由核酸的研究，进一步证实肠球菌和链球菌的不同，而将肠球菌自行独立成为一属。目前肠球菌属有18个种（species），其中以E.faecalis最为常见，约占分离菌株的85%至90%，其次为E.faecium，约占10%至15%。其他较为罕见的有E.gallinarum、E.casseliflavus以及E.durans等。E.faecium经常对ampicillin及vancomycin具有抗药性，是所有肠球菌中最难治疗的。
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革兰氏阴性菌（用G-表示）
主词条：革兰氏阴性菌
革兰氏染色反应呈红色（复染颜色）的细菌称为革兰氏阴性细菌，用G-表示。革兰氏阴性细菌的细胞壁中肽聚糖含量低，而脂类物质含量高，当用乙醇处理时，脂类物质溶解，细胞壁的通透性增加，使结晶紫-碘复合物易被乙醇抽出而脱色，然后又被染上了复染液（番红）的颜色，因此呈现红色。（若结晶紫染色过度即使是阴性菌也会变成紫色，若究竟脱色过度即使是阳性菌业会变成粉红色。）
对于革兰阴性菌，如使用抗生素不当，会加重病情的发展。因为革兰阴性菌的多聚糖外还有一层外膜，外膜由特异多糖，核心多糖和脂类A组成。而脂类A是内毒素的毒性部分和主要成分，若乱用抗生素，会破坏特异多糖和核心多糖，使得脂类A暴露，释放内毒素，加重病情。
社区获得型MRSA(CA-MRSA)
它的来源至今仍是个谜，研究者发现CA-MRSA有与医院里的MRSA不同的遗传背景，它会感染短期与医院没有接触的健康人群。与医院里的MRSA不同，CA-MRSA不具备多重耐药性，通常只对一两种抗生素耐药，并且多数可以用万古霉素杀灭。1997年，在纽约发现了CA-MRSA的另一个变种，这种菌株带有一种被称为PVL基因编码的强烈毒素。这是一种缩氨酸，由氨基酸形成的化合物，这种缩氨酸会造成称为中性粒细胞的免疫细胞爆炸，毁灭对抗感染的主要防御力量，24小时之内迅速破坏肺脏使人死亡。类似的变种出现了17个。它们的出现意味着MRSA家族开始走出医院，大开杀戒。监狱、体育馆等地方成为CA-MRSA感染的新根据地，病菌迅速在英、美两国蔓延，并有向世界性流行发展的趋势。
LA-MASA超级细菌
以英国为发源地的超级细菌已经开始在多个国家被发现。据美国媒体报道，这种超级细菌被称为LA-MASA超级细菌，主要存在于禽类体内，感染率极高，但是对人体危害很小。在澳洲墨尔本，已经有多人受到超级病菌的感染，目前美国检测部门也发表警告称这种病菌已经开始蔓延，在问题农场有三分之二的家禽受到感染，大量受感染的火鸡可能已经流向零售市场，人们需要多加防范。
