，有两个显著的亮点。一是研究推出新三板挂牌公司向创业板转板试点；二是提出实施新三板市场内部分层，现阶段先分为基础层和创新层，逐步完善市场层次结构。就前者来说，由于《意见》明确表示新三板要“坚持独立的市场地位”，表示“公司挂牌不是转板上市的过渡安排”，因此“转板试点”也就只是一个试点而已，转板公司数量有限，不会出现大规模转板现象。否则，好公司都转板了，新三板就成了垃圾板，这是不利于新三板发展的。而至于后者，才是《意见》的最大亮点所在。毕竟新三板的内部分层，事关新三板的成败，也是目前市场最关注的。
正如《意见》所言，对新三板分层管理，利于降低投资人信息收集成本。但分层管理的意义并不局限如此。因为在新三板分层的情况下，一些好的企业，优秀的公司都会集中在“创新层”，而一些相对平庸，或业绩普通甚至亏损的公司就会安排在“基础层”。这样的安排，不仅方便了投资者的投资，也即是利于降低投资人信息收集成本，让投资者对企业的优劣，或对企业投资的风险，一看就能有一个大概的了解。因此，此举极大地方便了投资。
而更重要的是，这种分层管理可以更好地留住好的企业。因为在优秀公司都集中在“创新层”的情况下，“创新层”挂牌公司就会成为投资者关注的重点，这些公司的投资价值就会得到充满的挖掘。如此一来，“创新层”公司转板到创业板上市的意愿就不会很强烈了。因为在“创新层”挂牌公司的投资价值已经得到了较大的体现，企业融资不再困难。而且在新三板大力发展机构投资者的情况下，股票交易也会活跃起来。“创新层”也就成了新三板内的“创业板”或“主板”市场。这对于新三板留住好的公司大有好处。也正因如此，新三板分层管理制度与“创新层”的发展状况，决定着新三板市场未来发展的成败。
