组织机构代码证如果已经过期，可以直接拿着税务登记证原件、营业执照原件、组织机构代码证原件办理三证合一，这种情况市场监管部门不会给予罚款处理的。
《关于落实 三证合一 登记制度改革的通知》(税总函前备〔2015〕482号)
二、切实做好“三证合一”工作衔接
根据有关工作部署，2015年10月1日要在全国全面推行“三证合一、一照一码”登记改革。各地税务羡悔段机关要加强与有关部门的沟通协调，强化国税、地税之间的协作合作，做好各相关职能部门之间的分工配合，统筹做好改革前后的过渡衔接工作，确保现有登记模式向“三证合一、一照一码”登记模式平稳过渡。
新设立企业、农民专业合作社（以下统称“企业”）领取由工商行政管理部门核发加载法人和其他组织统一社会信用代码（以下称统一代码）的营业执照后，无需再次进行税务登记，不再领取税务登记证。企业办理涉税事宜时，在完成补充信息采集后，凭加载统一代码的营业执照可代替税务登记证使用。
除以兄誉上情形外，其他税务登记按照原有法律制度执行。
改革前核发的原税务登记证件在过渡期继续有效。
