硝化细菌：他是利用空气中的氧来将氨气氧化成亚硝酸，再将亚硝酸氧化成硝酸。在氧化的过程中会有能量释放出来，释放出来的能量被用于合成有机物，所以是自养型生物。
能氧化某种无机物并利用所产生的化学能还原二氧化碳和生成有机碳化物的一类微生物。自然界中化能营养细菌种类不多，并且氧化无机物的专性很强，如硫酸菌只能氧化硫和硫化氢，亚硝酸细菌只能氧化铵盐，硝酸细菌只能氧化亚硝酸盐，氢细菌只能氧化氢，铁细菌只能氧化亚铁盐等。化能自养生物在土壤中有相当数量，对物质转化有一定的作用，特别在由岩石风化到土壤形成过程中自养微生物的先锋作用是不可低估的。自然界还有一种光能自养微生物，又称光合成细菌（光细菌），它们类似于植物，具有菌绿素，可用光能和大气中二氧化碳合成有机物。所不同的是绿色植物利用从水光解中产生的氢来还原二氧化碳和放出氧，而绿色硫细菌则是从硫化氢中得到氢、放出硫。
具体来说：
硫化作用
还原态无机硫化物如H2S、S或FeS2等在微生物作用下进行氧化，最后生成硫酸及其盐类的过程，称为硫化作用，进行硫化作用的微生物主要是硫细菌，可分为无色硫细菌和有色硫细菌两大类。
1．无色硫细菌 其中包括化能自养菌和化能异养菌。下面介绍几个不同类型的代表。
（1）硫杆菌 土壤与水中最重要的化能自养硫化细菌是硫杆菌属（Thiobacillus）的许多种，它们能够氧化硫化氢、黄铁矿、元素硫等形成硫酸，从氧化过程中获取能量。
2H2S＋O2→2H2O＋2S+能量
2FeS2＋7O2＋2H2O→2FeSO4＋2H2SO4+能量
2S＋3O2＋2H2O→2H2SO4+能量
除脱氮硫杆菌（T．denitrificans）是一种兼性厌氧菌外，其余都是需氧微生物。生长最适温度为28℃～30℃。有的硫杆菌能忍耐很酸的环境，甚至嗜酸。常见的有氧化硫硫杆菌（T．thiooxidans）和氧化亚铁硫杆菌（T．ferrooxidans），排硫硫杆菌（T．thioparus）等。
（2）丝状硫磺细菌 它们属化能自养菌，有的也能营腐生生活。生存于含硫的水中，能将H2S氧化为元素硫。主要有两个属，即贝氏硫菌属（Beggiatoa）和发硫菌属（Thiothrix），前者丝状体游离，后者丝状体通常固着于固体基质上。
此外，菌体螺旋状的硫螺菌属（Thiospira）、球形细胞带有裂片的硫化叶菌属（Sul－folobus）、细胞圆形到卵圆形的卵硫菌属（Thiovulum）等胞内都含硫粒，也都能代谢硫磺。
2．有色硫细菌 有色硫细菌主要指含有光合色素的利用光能营养的硫细菌，它们从光中获得能量，依靠体内含有特殊的光合色素，进行光合作用同化CO2。主要分为两大类：
（1）光能自养型 这类光合细菌在进行光合作用时，能以元素硫和硫化物作为同化CO2的电子供体，主要反应式为
CO2＋2H2S[CH2O]＋2S＋H2O
2CO2＋H2S＋2H2O2[CH2O]＋H2SO4
常见的如着色菌科（Chromatiaceae）和绿菌科（Chlorobiaceae）中的有关种（俗称紫硫菌和绿硫菌）。
（2）光能异养型 该类光合细菌主要以简单的脂肪酸、醇等作为碳源或电子供体，也可以硫化物或硫代硫酸盐（但不能以元素硫）作为电子供体。能进行光照厌氧或黑暗微好氧呼吸。目前，多用于高浓度有机废水的处理。常见种类大多为红螺菌科（Rhodospirillaceae），如球形红杆菌（Rhodobacter spheroides），沼泽红杆菌（R．palustris）等。
（四）反硫化作用
在厌氧条件下微生物将硫酸盐还原为H2S的过程称为反硫化作用。参与这一过程的微生物称为硫酸盐还原菌。反硫化作用具有高度特异性，主要是由脱硫弧菌属（Desulfovibrio）来完成。如脱硫脱硫弧菌（D．desulfuricans）是一典型反硫化作用的代表菌，其反应式为：
C6H12O6＋3H2SO4→6CO2＋6H2O＋3H2S+能量
产生的H2S与铁化学氧化产生的Fe2+形成FeS和Fe（OH）2，这是造成铁锈蚀的主要原因。
