不一定要分开的，其实主要还是取决于技术水平和开发成本，只要能够提供一个良好的用户体验，就是可行的方案。
另外，从SEO的方面考虑。单独开发手机站点的适配是最完善的，适配生效最快。但单独的M站也有缺点，我个人（技术有限）更倾向于自适应，
因为简单，而且很多建站模板也有不俗的用户体验。而百度官方，也是表示鼓励大家采用自适应建站，会不断完善这一块的适配功能
可以看一下几种实现手机站的方式优缺点：
自适应，就是通过判断浏览的设备，自动调节页面宽度
自适应站点有如下特点：
复杂程度中。需要使用能随屏幕尺寸而变的流体网格从头开始创建。如果网站需求较简单，有许多开源模板可供选择。如要构建包含额外编程的复杂的自适应网站，所需的时间会比较长。
性能高。无任何重定向，但需要有周全的计划才能实现最优的效果。数据量膨胀是最常见的错误。
维护需求低。创建后，更新内容会流向所有设备，维护工作量极低。
所有设备上的用户体验保持一致（一些设备专属的选项可通过服务器端程序添加）。
支持扩展至新平台。使用指定的断点和流体网格，可轻松扩展到新平台和新设备。
代码跳转，就是判断手机，使用独立的手机模板，使手机端更加精简
这种方式的忒点如下：
复杂程度中到高，取决于网站的复杂程度和您需要创建的代码库数量。代码适配所需的开发时间可能较长，且要求服务器端编程
性能高。可以简化为只包含为相应设备优化的内容，以实现最佳性能。
如果人工维护，将需要大量的资源。许多网站使用内容管理系统来避免这一问题，并自动在所有模板上发布内容。
单独的文件和服务器端代码（会在向用户传递网页前在您的服务器上运行）可以提供依设备而定的体验。
支持扩展到新平台。可轻松针对具体的设备（例如智能电视）创建模板，并通过同一个网址投放。
最后一种就是，楼主所说单独的分开开发的方式了
这种方式的特点：
复杂程度简单到中等。开发独立网站的速度可以非常快。小型企业可选用多种自动方案，以近乎实时的速度生成移动网站。
性能中。图片和其他网站内容可轻松针对小屏幕优化，但网站重定向经常会导致延迟问题。
维护中到高。更新主网站后，还必须单独在移动网站上进行更新。
可专门针对移动用户优化网站。
不支持扩展至新平台。这是智能手机专用的独立移动网站。新平台无法轻松集成到现有架构中。
