荚膜菌在其细胞壁外有一层厚≥0.2μmm而黏稠的结构称为荚膜，其化学成分在多数菌为多糖，少数菌为多肽。荚膜具有黏附宿主细胞和抗吞噬等致病作用以及抗原性，并且是鉴别细菌的指征之一。
许多革兰氏阴性（G-）菌及少数革兰氏阳性（G+）菌在其菌体表面有细而短、多而直的蛋白质丝状体，称为菌毛。菌毛分为两类：①普通菌毛：可促使细菌黏附于宿主细胞表面而致病。②性菌毛亦称F菌毛，性菌毛菌称为F+菌。 F+菌的菌体内质粒或染色体DNA，通过中空的性菌毛与F-菌表面相应的受体接合，可将遗传信息，如细菌毒力、耐药性及耐热性等，传递给F-受体菌，使之获得新的遗传性状。此外，性菌毛也是某些噬菌体的受体，使噬菌体吸附于F+菌，并使后者获取致病物质，如霍乱弧菌获取霍乱肠毒素。
