霍青桐识破清军阴谋,大败清军。胜后,霍青桐带病出走,途遇关东三魔,险遭污辱,幸得师父天山双鹰赶到救出。陈家洛此时方知李沅芷女扮男装,后悔自己辜负了霍青桐的一片芳心,与香香公主一同追赶,途中先后遇见狼群和张召重、关东三鹰、霍青桐,众人为抗恶狼暂时联手。陈家洛用霍青桐赠送他的短剑杀狼时,碰巧解开了其中的秘密,遂和霍青桐、香香公主逃出狼群,躲入迷城古洞,并得了一套奇高的武功。
陈家洛师父袁士霄为消灭群狼,设置一土城,用牛、马等将狼群引入城中。陈家洛用新学武功打败张召重,将其投入狼群之中。其间余鱼同得知师父马真被张召重所害,脱下袈裟誓为师父报仇,李沅芷借其报仇心切,设计陆菲青从中撮合,二人终于订下终身。
陈家洛从师父处取得有关乾隆身世的秘证,南下福建少林寺,欲了解义父被逐出少林的原因,经过连场比试,凭借武功与机智,弄清了全部事实真相。
香香公主被擒,乾隆欲据为已有,陈家洛与乾隆相见,以国家利益为重,答应帮助劝说香香公主;香香公主含泪答应了陈家洛,后发现乾隆并不真想反清复明,遂自杀示警,陈家洛伤心之余,抱着最后一线希望进入皇宫,险被毒死。众英雄大开杀戒,天山双鹰与红花会十当家章进身亡,最后捉住乾隆。
霍青桐正欲杀之为父、兄、妹及族人报仇时,安徽巡抚方有德突然抱婴儿出现。原来他与侍卫火烧福建少林寺抢得周绮之子来京向乾隆报功。他以婴儿性命相威胁,众人不忍见婴儿死于非命,遂放弃杀乾隆之念,活捉乾隆之私生子福康安出宫,迫使乾隆不与红花会为难。众人赶至香香公主之坟,打开后只见一滩碧血,香香公主的尸体已化作一缕香魂,陈家洛挥毫题上《香冢》诗词,并作铭后凄然而去,与红花会众英雄前往西疆栖身。