臭氧消毒利用臭氧的氧化性。但用在空居和汽车消毒对浓度的要求不一样。臭氧浓度在5MG/L，对车内室不会增加氧化程度。
目前汽车消毒的方法主要有以下几种：化学消毒、臭氧消毒、离子消毒和光触媒消毒，而市场最常用的消毒方法是臭氧消毒和化学消毒，而臭氧消毒是近来广受欢迎的，相比之下更便捷，杀菌更彻底。化学消毒的基本方法是用专用的消毒机将调配好的消毒液进行雾状处理，再对车内容易滋生细菌、病毒的部位进行喷洒和擦拭，通过化学作用达到除去病菌的目的，消毒后需对车内设施用清水擦拭，再用清洁的棉布擦干，也会留有消毒液的味道。
专家研究发现臭氧可以有效杀灭甲型H1N1流感病毒、乙肝病毒。臭氧消毒对车内饰等部件不会有所损坏也不会产生水汽，因其不含化学原料，所以对人体也无害，对环境无影响。它所采取的方法是把空气进行电解分离，产生臭氧，在短时间内破坏细菌、病毒、和其它微生物的结构，使之失去生存能力，特别是针对胺、烟碱细菌等病菌，消毒效果立竿见影，还可除异味。
做臭氧灭菌的过程为：先将一根连接着汽车专用臭氧消毒机的胶管伸入车厢内，打开汽车专用消毒机和车内空调，利用空调的空气循环，将汽车专用消毒机产生的高浓度臭氧送到车内的每个角落，整个过程只需要5分钟。消毒后车厢会残留一点臭氧味，不过由于臭氧可以很快分解为无色无味的氧气，所以只要将车窗打开一会儿，味道就会散去。臭氧消毒的效果可维持一个星期
