近亲繁殖现象在保护大熊猫的人工繁殖初期时是无法避免的，但如今随着熊猫数量慢慢变多，管理逐渐规范，我们已经在避免近亲繁殖了。
大熊猫刚刚被发现的那段时间里，数量十分稀少。因为野生大熊猫的繁殖能力非常低，野生雌性很难受孕，所以大熊猫被列为濒危物种，是我国一级保护动物。在我国这些年来的不断努力下，大熊猫的数量已经在逐渐变多了，从濒危物种逐渐逐渐变为了”易危物种“，这与人工授精繁殖是离不开的。
使野生大熊猫交配的困难是出了名的。一项研究显示，在一年里，雄性大熊猫的繁殖有效期是六个月或更长，然而雌性大熊猫的发情期只有一至三天。另外，由于雌性大熊猫的交配期很短，雄性大熊猫恰好能在那几天与雌性大熊猫相遇更是需要长途跋涉的，所以此行想要受孕非常困难。为了保护大熊猫，我们只好进行人工授精。
如今，圈养大熊猫的管理已走向规范化，已经建立了所有圈养大熊猫自己的谱系。通俗地说，谱系就是一个家谱，它清楚记载着每只编号大熊猫个体的来龙去脉，这不仅包括它的来源地、出生、死亡时间、雌雄性别、父母和后代的情况，而且还包括该只大熊猫饲养地的转移时间及具体地点、外形特征和繁殖情况等等。
这样一次又一次地记录在该个体的谱系编号里，直至记录下该个体的死亡时间及地点。根据大熊猫谱系，可以查明大熊猫个体间的亲缘关系，从而在婚配时避免近亲繁殖。
