让SATA和PATA和平共处的关键在于其占用的IDE通道位置不能冲突。还要注意，DOS/Win98/WinMe系统只能支持4个IDE设备，而Win2000/XP/2003系统可支持6个设备（注：第三方的SATA控制器可突破此限制）。关于SATA占用IDE通道位置的设置部分，各厂家有所不同。
以Intel 865PE芯片组的ICH5南桥为例：
进入BIOS后，选择Main下的IDE Configuration Menu，在Onboard IDE Operate Mode下面可以选择两种IDE*作模式：
兼容模式和增强模式（Compatible Mode和Enhanced Mode）。
其中Compatible Mode，可以理解为把SATA硬盘端口映射到并口IDE通道的相应端口，通常适用于DOS/Win98/WinMe系统；
Enhanced Mode下的SATA硬盘将使用独立的IDE通道，不与原PATA设备冲突，但仅适用于Win2000/XP/2003系统。
一、BIOS设置部分
由于各家主板的BIOS不尽相同，但是设置原理都是基本一致的，在此只介绍几种比较典型的BIOS设置，相信读者都能够根据自己主板BIOS的实际情况参考本文解决问题。
1.南桥为ICH5/ICH5R的主板
先以华硕的P4C800为例，这款主板芯片组为i865PE，南桥为ICH5/ICH5R。进到BIOS后，选择Main下的IDE Configuration Menu，在Onboard IDE Operate Mode下面可以选择两种IDE*作模式：兼容模式和增强模式(Compatible Mode和Enhanced Mode)。其中兼容模式Compatible Mode，可以理解为把SATA硬盘端口映射到并口IDE通道的相应端口，当你选择这种模式时在下面的IDE Port Settings中会有三个选项：
Primary P-ATA+S-ATA：并行IDE硬盘占据IDE0+1的主通道(Primary IDE Channel)，串行SATA硬盘占据IDE2+3的从通道(Secondary IDE Channel)。也就是说这时主板上的第二个并行IDE接口对应的端口不可用。
Secondary P-ATA+S-ATA：与上面正相反，此时主板第一个并行IDE接口(Primary P-ATA)上对应的端口不可用，因为给SATA硬盘占用了。
P-ATA Ports Only：屏蔽了串行SATA硬盘接口，只能使用并行接口设备。
注：前两种模式中，主板上的SATA1接口自动对应IDE通道中*主盘位置，SATA2接口自动对应IDE通道中*从盘位置。
当选择模式为增强模式Enhanced Mode时，其下的端口设置的字样变为Enhanced Mode Supports On，其中也有三个选项：
P-ATA+S-ATA：并行和串行硬盘并存模式，此时SATA和PATA通道都相互独立互不干扰，理论上4个P-ATA和2个S-ATA可同时接6个设备，实际上得根据不同主板而定，有的南桥芯片就只支持4个ATA设备。此时SATA1口硬盘对应Third IDE Master(第三IDE通道主盘)，SATA2口硬盘对应Fourth IDE Master(第四IDE通道主盘)。
S-ATA：串行硬盘增强模式，此时理论上支持4个串行硬盘，但还得看主板的支持情况(如果是ICH5R芯片组如P4P800，想组RAID模式，则必须要选择此项，并将Configure S-ATA as RAID项设为Yes，S-ATA BOOTROM项设为Enable，设置后BIOS自动检测的时候按“Ctrl+I”进行RAID设置)。
P-ATA：其实还是一种映射模式，SATA硬盘占据的是第一个IDE通道，SATA1口对应第一个通道的主盘，SATA2口对应第一个通道的从盘。
当你使用的是Win98/Win NT/Win2000/MS-DOS等传统的*作系统时，由于它们只支持4个IDE设备，所以请选择兼容模式Compatible Mode，并根据你的实际硬盘数量和位置选择IDE Port Settings中*对应选项；当你使用的是WinXP/Win2003等新型的*作系统时，可以选择增强模式Enhanced Mode来支持更多的设备。当然如果你安装Win98+Win XP双系统的话，也只好选择Compatible Mode了。另外，有的主板BIOS有BUG，致使在单个SATA硬盘上安装Windows 98SE系统时不能正确安装SATA硬盘(如：华擎P4VT8)，只需要升级BIOS版本到最新版就可以解决了。
注：虽然SATA硬盘本身并没有主从之分，但是如果使用了端口映射的模式，当你想要并行硬盘和串行硬盘共存时，还是得注意硬盘所占的位置不要冲突了，而且启动顺序也需要在BIOS中根据实际情况进行相应调整
