细菌的特殊结构有荚膜、鞭毛、菌毛和芽胞。
医学实践意义：
【荚膜】鉴别细菌的依据之一
【鞭毛】能否运动可用于鉴定；鞭毛具有特殊H抗原，可用于血清学检查。
【菌毛】性菌毛能将F+菌的某些遗传物质转移给F-菌，使后者也获得F+菌的某些遗传特性。细菌的抗药性与某些细菌的毒力因子均可通过此种方式转移。
【芽孢】①抵抗力强的芽胞可在自然界存活多年，成为某些疾病的潜在传染源；②特别注意能形成芽胞的细菌污染了病房、手术室等，必须封闭房间进行彻底灭菌；③因芽胞对理化因素的抵抗力强，故可以芽胞是否被杀死而作为判断灭菌效果的指标；④细菌芽胞的形状、大小、位置等随菌种而异，具有重要鉴别价值。其功能是：①芽胞的抵抗力很强；②芽胞在适宜条件可以发育成相应的细菌；③鉴定细菌的依据之一。
