1959年，在原苏州医学院附属第一医院儿科的基础上独立组建，经过几代人的努力，现已发展成为一所集医疗、教学、科研、预防保健为一体的综合性三级儿童医院。2001年设立苏州大学儿科医学研究所。医院多次被评为江苏省、苏州市文明单位，2005年被评为江苏省医院管理年活动先进单位。医院现有职工 600余名，卫技人员近500名，其中高级职称60余名，享受国务院特殊津贴专家11名，江苏省有突出贡献的中青年专家3名，博士生导师3名，硕士生导师30余名，省“333”工程培养对象6名，省“135”工程重点医学人才2名，省“青兰工程”学术带头人1名。医院占地面积18170平方米，实际开放床位362张。2005年完成门急诊46万余人次，收治病人近1.7万，完成手术例数2300余台。固定资产1.59亿元：拥有磁共振、多层螺旋CT、DSA和三级医院必备的医疗设备。骨科、新生儿科为江苏省临床重点专科；血液科、小儿普外科是江苏省“135”工程重点学科合作单位；小儿肾脏科为苏州市临床重点专科。
医院在研国家自然科学基金课题 2项，国家中医药管理局课题1项，在研省级课题3项，厅级课题10余项，参与国际科研合作课题3项。每年在国内外杂志上发表论文100余篇(含被SCI收录)。获得省政府科技进步三等奖1项，省卫生厅新技术引进一等奖3项，省新技术二等奖12项，苏州市科技进步奖19项，苏州市新技术奖14项。儿童疾病综合管理(IMCI)课程获省教育厅教学成果一等奖。此外，医院每年还举办2-3个国家级及4-5个省级继续教育学习班，正逐渐成为江、浙、沪、皖地区儿科医师的进修和培训基地。
医院现有儿科学博士点 1个，儿科医学、急救医学硕士点2个，每年承担着四十余名硕、博士研究生和数百名儿科医学本科生教学任务以及临床见、实习的带教任务。
近几年来，省市各级领导先后来医院视察指导工作。医院对外交流日渐增多，先后与英国、美国、法国、加拿大、日本、丹麦、澳大利亚、以色列、巴西、香港等国家和地区建立了友好协作关系，聘请国外专家担任我院客座教授，派遣中青年专家赴英、美等国著名院校进修学习，开展国际学术交流。
