商业银行的资本结构是指商业银行的债务性资金来源与自有资本之间一的比例关系。
资本结构不仅决定银行的筹资成本，还影响银行的最终价值。同时，银行作为通过经营风险来盈利的商业性企业，在一定程度上也处于资本结构理论应用范围内。但银行对一国经济的促进作用和肩负的责任远多于一般工商企业，同时银行破产对经济的破坏也非常巨大，因此，一直以来银行受到一系列更严格的监管。
对此，理论界以分析资本平均成本为主要内容的资本结构管理和融资结构优化工具在银行中的应用比较有限，因为一般意义上的资本结构理论并没有考虑到银行除了受到市场均衡资本需求影响外，更大程度上还受到存款保险制度、法定准备金、监管资本等方面的严格限制，正是这些特殊性，使得银行的资本结构研究远比一般工商企业复杂。
