以下回答由“济南商律师”提供，如需转述请注明出处：
1、根据我国的法律规定，没有明确说特种车辆是可以闯红灯行驶的。急救车辆是这样，更何况转院时的车辆了。这种情况下，这个救护车的所在单位，即这个医院必须承担侵权的责任。
2、医院的说法没有道理的。这种交通事故案件，最好等待交警的事故认定书出来后，根据具体的责任分配，来进行各方的赔偿。但是，没有交通事故的认定书是不耽误赔偿的，因为你们在他的车上造成伤害是既定的事实了。你可以迳行去法院起诉，也可以聘请一位律师来进行具体的交涉。
3、具体赔偿的话包括医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、必要的营养费以及精神损害抚慰金。
因为“脑梗塞右侧瘫痪”有可能构成残疾，你可以去做司法医疗鉴定来证明伤残等级，以及这个伤残是否是这次车祸引起的，如果能证明这次车祸因伤致残的，残疾赔偿金、残疾辅助器具费、被扶养人生活费，以及因康复护理、继续治疗实际发生的必要的康复费、护理费、后续治疗费，赔偿义务人也应当予以赔偿。
希望我的回答可以帮到你！
