1、法律责任不同
有限责任公司由各股东以出资额为限承担有限责任。而有限合伙企业中，普通合伙人以其全部财产承担法律责任，有限合伙人以出资额为限承担有限责任。
2、税收不同
有限责任公司的投资所得和股东分红均要征税。有限合伙企业由合伙人分别缴纳所得税。简单来说在税收上面，有限公司需要缴纳企业所得税，个税，增值税等各种税，而有限合伙只需要缴纳个人所得税即可。
3、利润分配不同
合伙企业原则上利润分配方式按照合伙协议的约定分配，没有约定或者约定不明的按照合伙人实缴出资比例分配，无法确定出资比例的，合伙人平均分配。有限责任公司原则上利润分配方式按股东实缴的出资比例分配，但是约定不以实缴出资比例分配的除外。
4、交税比例不同
有限责任公司年终要缴纳缴纳20%或25%的企业所得税，假设税后利润全部分红，还要缴纳20%的个人所得税，也就是说年利润的36%或40%被国家以税收的形式收取。合伙企业是按个体工商业户进行征收个人所得税，适用的是五级超额累进税率，最高税率是35%。
5、对于生产经营所得
对于企业的生产经营所得，合伙企业与有限公司的纳税有差异：
合伙企业“先分后税”（没有企业所得税，只交合伙人个人所得税），有限公司“先税后分”（双重征税：企业所得税、股东个人所得税）。
6、对于股息、红利所得
对于企业对外投资分回的利息或者股息、红利，两者的纳税无差异：都不用缴纳企业所得税，只需缴纳合伙人（股东）个人所得税。
有限责任公司是按企业纳税，而合伙企业是按自然人缴纳个人所得税，合伙企业适用5%～35%的五级超额累进税率，计算征收个人所得税。
也就是说，当合伙企业的“合伙人”增加的时候，每个投资者分得的所得越少，适用的税率也就越低，增加合伙人（如：增加妻子、子女为合伙人）就等于降低税负。选择经营模式需谨慎。
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