个体户和公司的区别主要是以下几点：
一、注册流程
如今深圳办理工商登记实行全网上流程办理，这个两者都是一样，一个系统进，都是“一照一码”登记。两者需要提交的资料也基本一致。
个体户需要：名称(两到三个备查)，经营地址及大小，经营范围，注册资金，负责人身份证件。注意，个体户的名字不能交某某公司，而是深圳市xx区xx商行/店/经营部等。
个体户不需要：监事，公司章程，股东投资比例这些不需要，毕竟就一个人，但是其他的材料都不能缺少。
二、税务
个体户要按照税务机关的规定正确建立账簿，进行核算。个体户缴税的方式有三种：
1、查证征收：主要是对象是账证健全、核算准确的个体工商户;
2、定期定额征收：对象是生产经营规模小又没有建账能力的个体工商户;
3、核定征收：具有一定情形的个体工商户，税务部门有权核定其应纳税额。
个体工商户不能申请增值税为17%的增值税发票，只能申请小规模纳税人的3%。而有限公司可以申请到17%的一般纳税人增值税发票。缴税的多少，根据经营情况而定，跟是不是个体户或公司没关系，个体户也可以成为一般纳税人，公司也有小规模纳税人。
三、注册资本
1、个体户在进行工商注册登记的时候，注册资本没有最低要求。
2、有限公司在注册资本最低为3万元，一人有限公司的最低注册资本为10万。
四、承担的法律责任
个体户如果经营亏损，要自己负责全部债务。有限责任公司如果亏本了，可以向法院申请破产保护，比如你注册时的注册资本是30万，但是你欠了别人200万，因此你只要还50万就可以了，比人还拿你没办法，因为这是受法律保护的。
五、优惠政策
有限公司要每个月做账报税，可以享受税收优惠政策;而个体户既没有投资风险也不要会计做账，所有享受不到优惠政策。
六、纳税及税收计算方式
个体工商户缴税一般是税务机关根据其所在位置/规模/员工人数/销售商品等来估算销售额，然后再定税，不管当月收入多少，有没有收入都要按照定税金额缴税。而有限责任公司通常要有健全的会计核算和账目，缴税也是按照企业自己申报的收入进行，有就交，没有就零申报。
1、个体户或个人独资企业的经营所得只缴纳个人所得税;有限责任公司的经营所得既要缴纳企业所得税，也要缴纳个人所得税。
2、个体户或个人独资企业一般采取定额率征税;有限责任公司的征税，营业交易环节按发票征税，经营所得环节一般按照核定征收或者查账征收这两种。
从上面的介绍来看，个体工商户和公司各有自己的优点。有些人觉得个体户一般不会被工商部门抽查。其实不是这样的，个体户不但会被查，且会被严查，因为有不少个体户钻空子，办理营业执照却没办经营许可证;或者是发生变更却不到工商部门进行备案;也可能应为经营期间卫生环境、消防安全等问题，因此，个体户经常会收到重点抽查。
所以，不管是个体户还是公司，还是要根据自己的情况来选择，如果你只是想经营水果贩卖，开个水果店就行了，没必要开公司。但是如果你向从事农产品之类的贸易，可能涉及到跨地区大宗交易的，较好就是注册公司了。
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