1、单位性质不同
企业单位是一种生产性单位，事业单位是一种社会组织。
2、单位目的不同
企业单位是自负盈亏 ，在经营等方面有自主权，事业单位一般都是服务于社会的服务单位 ，一般带点公益性质 ，有的是靠财政全额拨款， 或是财政补贴 ，或是自己单位也有收入 ，虽有的有盈利，但不是其直接目的。
3、单位制度不同
企业单位除了要遵循国家相关的法律政策，针对企业内部会制定内部控制制度，事业单位的制度一般都是统一规定的，归相应的政府行政主管部门或只能部门管。
4、单位人员构成不同
企业单位都是合同制的聘用人员，事业单位里面有公务员，有事业编制人员，有聘用人员等。
5、财务账务处理不同
企业单位按企业会计准则处理，事业单位按事业单位的财务规则进行处理。
6、资金来源不同
企业单位主要靠自己筹集资金，或融资，事业单位有的是靠财政全额拨款， 或是财政补贴 ，或是自己单位也有收入 。
扩展资料
企业单位的特点是自收自支，通过成本核算，进行盈亏配比，通过自身的盈利解决自身的人员供养，社会服务，创造财富价值。
国有企业作为一种生产经营组织形式，同时具有商业类和公益类的特点，其商业性体现为追求国有资产的保值和增值，其公益性体现为国有企业的设立通常是为了实现国家调节经济的目标，起着调和国民经济各个方面发展的作用。
企业单位的登记在工商行政管理部门进行。企业单位与职工签订劳动合同。发生劳动争议后，企业单位进行劳动仲裁。
参考资料来源：百度百科-企业单位
