根据消毒剂的化学特性，化学消毒剂可分为七大类。
各类化学消毒剂的杀菌机理和特点各不相同：
（1）氧化类消毒剂：杀菌机理是释放出新生态原子氧、氧化菌体中的活性基团；杀菌特点是作用快而强，能杀死所有微生物,包括细菌芽孢、病毒。以表面消毒为主，如二氧化氯、双氧水、臭氧等，该类消毒剂为灭菌剂。
（2）醛类消毒剂：杀菌机理是使蛋白变性或烷基化；杀菌特点是对细菌、芽孢、真菌、病毒均有效。但温度影响较大。如甲醛、戊二醛等。该类消毒剂可做灭菌剂使用。
（3）酚类消毒剂：杀菌机理是使蛋白变性、沉淀或使酶系统失活；杀菌特点是对真菌和部分病毒有效。
（4）醇类消毒剂：杀菌机理是使蛋白变性,干扰代谢；杀菌特点是对细菌有效,对芽孢、真菌、病毒无效,如乙醇、乙丙醇等。该类消毒剂为中效消毒剂，只能用于一般性消毒。
（5）碱、盐类消毒剂：杀菌机理是使蛋白变性、沉淀或溶解；杀菌特点是能杀死细菌繁殖体，但不能杀死细菌芽孢、病毒和一些难杀死的微生物。杀菌作用弱，有强腐蚀性，如硝酸、火碱、食盐等。只能作为一般性预防消毒剂。
（6）卤素类消毒剂：杀菌机理是氧化菌体中的活性基因，与氨基结合使蛋白变性。特点是能杀死大部分微生物，以表面消毒为主,性质不稳定，杀菌效果受环境条件影响大。
（7）表面活性剂类消毒剂：杀菌机理是改变细胞膜透性，使细胞质外漏，妨碍呼吸或使蛋白酶变性。杀菌特点是能杀死细菌繁殖体，但对芽孢、真菌、病毒、结核病菌作用差。碱性、中性条件下效果好。
