1991年进行建镇并乡撤区，经贵州省人民政府批复，撤销原城关、响水、双山、坡脚、马场、理化、鸡场、六龙、百纳、达溪、瓢井、长石、沙厂13个区建制，将原108个乡（镇）合并建立36个科局级乡镇。
2003年，大方县人民政府批复撤并部分行政建制村，将原499个行政村、30个居委会，撤并建为367个村和22个社区居委会。
截止2007年底，全县共辖10个镇，26个乡（其中18个民族乡），有367个村民委员会和22个社区居委会。2007年12月9日，百里杜鹃管理区党工委、管委会与大方、黔西两县签署风景区托管协议，大方普底、大水两个民族乡交百里杜鹃管理区托管，2008年又将黄泥塘镇在拱、箐门和百纳乡龙坪、龙丰、龙竹5个村划归百里杜鹃管理区托管。 县人民政府驻地大方镇。
2013年4月，①撤销鸡场乡、黄泥塘镇，合并设置新的黄泥塘镇，以原鸡场乡、黄泥塘镇地域为新设置黄泥塘镇的行政区域，镇人民政府驻黄泥村；②撤销大方县高店乡，设置对江镇，以原高店乡及大方镇的金星、湾子、对江、箐木、法书、龙井、元宝、杉林、花果等9个村地域为对江镇行政区域，镇人民政府驻堰塘村。③撤销大方镇，设立慕俄格古城、顺德、红旗三个办事处。 大方县植物资源有森林、草地、农作物、药用植物和经济林植物等。境内植物不仅有丰富的菌类，还有众多蕨类以上的高等植物，仅“百里杜鹃”林区就有菌类131种，其中药用菌43种，食用菌58种，毒菌22种。高等植物120种，分50科、84属，其中被子植物44科78属113种，裸子植物1种，蕨类植物5科5属6种。大方植被为亚热带常绿阔叶林带，大部分属海拔1500~1700米的中山山地，由于滥砍乱伐，1987年全县植被覆盖率仅为10.36%，经过后20多年植树造林、退耕还林、封山育林、长江中上水土流失工程治理等工程措施，到2008年县境林地面积1043.23平方公里，森林覆盖率为29.82%，加上灌丛林等，全县森林植被覆盖率达33.67%。
大方县境内历史上野生动物种类繁多，常见的有鱼、两栖、爬行、鸟、兽、昆虫等类野生动物。兽类有虎、豹、野山羊（麂）、狐、獐等兽类31种，占贵州省兽类134种的23.14%。截至2008年，大方县已查明的有鸟类104种，占贵州省鸟类404种的25.5%。 截至2001年，大方县己探明的矿产种类有无烟煤、硫铁矿、铁矿、硅石、高岭土、大理石、石灰石、粘土、石膏、方解石、冰洲石、白云岩、玄武岩、水晶、波缕石、汞、砂岩铜矿、铅锌矿、铝土矿、钼矿等37种主要矿产，大型矿床3处、矿点100余处。
2001年底，探明的矿产储量主要有：无烟煤112亿吨，硫铁矿109亿吨，石灰石125亿吨，高岭土70多万吨，优质铁矿30余万吨，铅锌矿13万吨，大理石约936万立方米等。硅石储量不少，其中仅一个矿床储量就有180万吨。全县尤以无烟煤、硫铁矿、石灰石、水泥和砖瓦原料最具有优势，在经济发展中占有重要的地位。大方矿产资源储量潜在经济价值较高的是无烟煤和硫铁矿，特别是无烟煤属优质煤，是全国200个重点产煤县之一，具有建设大型坑口火电厂的优势条件，已建成4×300MW的大方火电厂。硫铁矿是贵州省大型矿区之一，大理石有“晶墨玉”及“残雪”等名贵品种。
