就我目前工作和学习的经验来说，首先一般的电子显微镜需要高电压，40kv-300kv，超高电压电镜就不说了，所以首先飞行器上需要有个变压器以及足够多的能源来提供电力。
其次，稳定的电子束流需要足够的真空度和磁屏蔽环境，否则电子束流会很混乱，是不能够成像的。
最后，运用电子显微镜观测样品是一个很精细的工作，从制样到装配，观测这一系列的步骤都需要专业的人员来操作，目前而言机器以及远程操控是无法胜任的。
就目前飞行器的转载空间来负载上述这一整套的设备是很困难的。不过如果超大型科研空间站在未来上天的话，也许会成为可能。不过就投入产出而言，还不如把样品送到地面再观测。
