1、第1集（收服胖胖翁）
小光是住在神奥地方的十岁少女。今天是她以新人神奇宝贝训练家身份出去冒险旅行的日子。她为了拿到第一只神奇宝贝，朝向隔壁镇的神奇宝贝研究所前进，但是中途却迷了路。
而此时，新人用的神奇宝贝，草苗龟、小火焰猴、波加曼，刚好在研究所内大打出手，导致研究所内的神奇宝贝们也窜逃出去…...
2、第5集（收服嫩苗龟）
在前往祝庆市的途中，皮卡丘被火箭队的热气球带走。小智在姆克儿帮助下，击落热气球。可是，热气球坠落的地方是在有点远的湖泊边，小智一行人立即往湖泊的方向跑去。
另一方面，皮卡丘被野生的草苗龟搭救了。干劲十足的草苗龟保护皮卡丘，赶走了火箭队，甚至连随后赶到的小智一行人也被它误会成敌人…...
3、第34集（收服叉尾浮鼬）
小智一行人在森林中，遇见一群带着负伤的神奇宝贝的训练家。询问之下，原来是附近的河边有非常强大的泳气鼬出没，并且接连打败它所挑衅的对战对手。
「既然是那么强的泳气鼬，那我就要收服它」，小智干劲十足地往河边去，却在那见到小光的劲敌「小望」的身影。她似乎也已经打算要收服泳气鼬…...
4、第52集（收服小火猴）
在前往下一间道馆所在地帷幕市的旅途中，小智一行人跟往常一样，和神奇宝贝们一起用餐。但是，新同伴小火焰猴对于这种和真司旅行时迥异的气氛感到困惑。面对这样的小火焰猴，小智邀它一起为道馆赛进行特训，练习的对象是小光与波加曼，但是，小火焰猴输了。
这时候，小火焰猴想起真司严苛的视线，担心会因此受到责备而害怕不已。然而小智一行人的态度却完全和它想的不同！小火焰猴会从这样的小智他们身上感受到什么呢？
并且，大家突然遭到成群的猫鼬斩袭击，小火焰猴之外的神奇宝贝们都陷入危机！面对成群的猫鼬斩，小火焰猴最后能够救出大家吗？
5、第64集（收服天蝎）
在前往帷幕市的旅途中，来到广阔沙地的小智一行人，决定大家好好玩一玩。神奇宝贝们在沙地上兴奋玩乐的时候，沙地突然开始摇晃，脚底的沙子随着大片飞沙隆起。然后，「重量神奇宝贝」河马兽从沙中现身。
好奇心旺盛的帕奇利兹爬到河马兽头上研究那张大嘴，结果竟然滑进嘴巴里去了！小智他们紧张万分的要去救帕奇利兹，但是河马兽又钻进沙地失去踪影，让大家束手无策。这时候，以前被小智一行人送回群体去的怪河马出现在他们面前！
