是的，旅顺在一段时间内禁止日本人入内。以下是详细的回答：
1.历史背景
旅顺位于辽宁省大连市南部，是中国近代史上重要的海防重镇，曾多次成为国家军事要塞。1895年，中日甲午战争爆发，中国在此战中败北，被迫签订《马关条约》，割让台湾及澎湖列岛给日本，同时开放旅顺口。
2.新开港遭遇问题
随着旅顺口的新开港，不少日本商人和移民前往旅顺定居，但他们也带来了一些问题。如经济竞争、地方安全等。加上日本政府在朝鲜半岛上推进其殖民统治，与中方关系矛盾加剧。
3.旅顺口火药库事件
1904年，日俄战争爆发，旅顺成为最后一站，一场攻防战开始，双方都投入大量兵力和物资。而随之而来的是旅顺口火药库事件，据称其中就有日本人的参与。这场事件使舆论中对日本人存有敌意，甚至导致旅顺甚至禁止日本人入内。
4.指令下发
后来，1909年，徐世昌下令旅顺关闭，“禁日”措施也自动实施。但在他之后，维新派代表们上台，取消了“禁日令”，并劝日本商人重返旅顺，但人数大幅减少。
5.总结
因为历史背景、地缘原因和部分因素，旅顺曾在一段时间内禁止日本人入内。历史的真相有时候需要我们多加探究，才能对当下的国际关系有更为正确的认识。
