夫妻分居后，仍有共同的房屋贷款需要偿还。这种情况下，需要考虑以下几个问题：
1. 是否能够协商解决：如果夫妻离婚后还保持良好的关系，可以协商共同偿还贷款，或者其中一方偿还全部金额后向另一方索要对应的部分。
2. 是否有约定双方偿还贷款比例：如果在分居或离婚前已经约定了双方偿还贷款的比例，那么需要按照这个比例进行偿还。
3. 担保责任的归属：如果借款人是夫妻共同担保，那么即使一方不再居住在房屋内，也需要继续承担相应的担保责任。
4. 重新评定还贷能力：如果离婚后一方收入发生变化，需要重新评定还贷能力，并根据实际情况制定还贷计划。
总之，夫妻分居后的还贷款需要根据双方的实际情况和协商结果来确定偿还方式。如果无法协商解决，可以向相关机构申请调停或采取法律手段解决。
