饮用一杯咖啡后，人体内的消化和代谢过程是不同的，所以回答这个问题的时间是不确定的。然而，以下是针对一般情况下可能发生的一些消化和代谢阶段：
1.吞咽：当你喝下一口热咖啡时，它会在喉咙中停留片刻，你可能会感觉到暂时的降温想要咳嗽。
2.胃：咖啡从口腔进入胃部。咖啡含有酸性物质，可以刺激胃的分泌，来帮助消化。消化液花费大约半小时到两个小时就可分解咖啡中的成分。
3.肠道：咖啡的消化和吸收主要发生在小肠，而且两者都需要时间。从嘴里经过的时间是不到一分钟，但最后彻底消化和排出身体可能需要数小时至一天时间。
4.代谢：咖啡因是咖啡中的一种化学物质，可以刺激神经系统，增加心跳和血压，使人消耗更多的能量。人体内消化掉一杯咖啡的时间因人体不同而异，可能需要数小时到一天。咖啡因通常在体内停留四到六小时左右。
总之，一杯咖啡在体内消化的时间是由多种因素影响的，包括个人体质、咖啡成分、胃肠功能等等。通常消化过程可能需要半小时到数小时，而代谢的过程可能需要更长的时间并受多种变量影响。
