开票申请单作为一种内部审核程序和财务管理手段，可以帮助企业控制开票环节的风险，提高资金管理的透明度和风险控制的有效性。然而，仅仅有开票申请单并不能完全确保开票人的安全。具体来说，以下几点需要注意：
1. 开票申请单本身可能存在漏洞或者审批不严的情况。例如，开票人虚构了发票信息或者通过内部关系获得了违规的开票权限等，这些情况都会使开票申请单的效力受到影响。
2. 开票申请单只是一个过程控制手段，不能代替实质控制。开票人需要负责核对开票信息的真实性和合法性，防止发生误开、漏开、重复开票等问题，从而避免不当开票造成的损失。
3. 单一的开票申请单难以满足企业内部财务管理的需要，企业还需要建立完善的财务管理制度和内部控制机制，以确保开票环节的风险得到科学有效的管控。
4. 最终管理层面上，应该加强对开票人的管理和监督，及时发现和纠正开票人存在的风险和问题，防止企业因为开票环节而发生损失或者法律风险。
综上所述，开票申请单只是财务管理中的一种手段，必须与其他管理制度和内部控制机制相适应才能真正发挥效力。同时，企业需要认真落实开票人的责任和义务，对开票环节进行全方位的管理和监督，从而最终确保企业在开票环节的安全和合规。
