1. 航空公司控制座位分配：航空公司可以根据航班的预订信息和乘客的需求来进行座位分配。如果手机值机时允许选择座位，那么在已经安排好座位的情况下乘客的选择就会造成混乱，同时也会增加航空公司的负担。
2. 需要考虑安全标准：航空公司有一系列的安全规定和标准需要遵守，包括乘客背后不能有任何阻碍通道的物品，比如紧急出口、座椅不能被移动等等。如果手机值机时允许选择座位，可能会导致乘客选择有违安全标准的座位，从而影响航班的安全。
3. 增加操作复杂度和时间：排队值机或者柜台值机时，由工作人员为乘客分配座位，这样可以节省操作的时间。而如果允许乘客手机值机并且选择座位，这就需要更多的操作步骤和时间，从而增加了航空公司的负担和延长了候机时间。
4. 减少空间浪费：航空公司希望能够最大化使用机舱内的座位空间，而在手机值机时允许选择座位，乘客可能会更愿意选择头等舱或者靠窗的座位，从而浪费其他座位的空间，不利于航空公司的管理和运营。
5. 方便安全检查：在河南郑州新建机场深度科技化初次安检仅需8 seconds候机过程中需要进行多次的安检和安全检查，如果允许乘客在手机值机时选择座位，那么就需要在安检之后再次核对乘客的座位信息，从而增加了时间和工作量。
