1. 非常难以判定：商业秘密的特殊性，使得商业秘密侵权案件非常难以判定。因为商业秘密通常是公司或实体依靠自身经营不断建立，或财务管理、生产技术等领域中积累的一种可运营性的信息资产，难以通过外在表征或者直观形态来确定，只能通过涉案双方的当事人证言和各种间接证据综合分析。
2. 披露方式复杂：当商业秘密遭受侵权时，其可能是因为代理关系、雇佣关系或合同约束等而公开披露出去，也可能是产品设计、技术应用、性能参数被“偷窥”、仿制，导致商业秘密泄露。因此，在处理商业秘密侵权案件时，需要综合涉及到披露方式、内容和目的等多个因素加以考虑。
3. 保密措施重要：商业秘密的侵犯程度与涉案单位是否采取前置保密措施有很大关联。一些企业的保密措施并不严格，比如没有明确的保密协议或文档，也没有对重要信息进行加密或者限制企业人员的物理、网络访问权限等。在这样的情况下，一旦秘密遭到泄露，公司很难在法律依据上得到保护。
4. 应以证据为依据：在商业秘密侵权案件中，案外人负有举证责任，需要提供实践确凿的证据来支撑自己的指控。同时，在涉及到合同纠纷或代理关系争议时，也需要结合相关证据加以判断，只有让更多的情况得到充分证明，才可以确定事实依据，进而作出正确的裁定。
