1. 主合同无效补偿协议可能无效。
主合同是指已经签订并生效的合同。如果主合同被认定为无效，那么相对应的补偿协议也可能会被认定无效。主合同无效的原因可能包括违反了相关法律法规、瑕疵或者存在重大漏洞等。
2. 补偿协议在一定条件下可能被认定为有效。
即使主合同无效，补偿协议也有可能被认定为有效。补偿协议通常需要满足以下条件：双方当事人真实意思表示、合法的目的和内容、有明确的补偿金额等。只要这些条件都得到满足，补偿协议就可以独立存在并发挥作用。
3. 补偿协议中的无效条款可能会被违法。
尽管补偿协议可以被认为是有效的，但是其中如果存在违反相关法律法规的条款，那么这些条款会被认定为违法无效。例如，如果补偿协议中规定被补偿方必须承担超过法律约定范围内的责任，那么这个规定就是无效的。
综上所述，主合同无效不一定代表补偿协议无效，而且补偿协议中的无效条款也会受到法律制裁。因此，在签订补偿协议时，应该特别注意相关法律要求，并尽可能避免存在风险隐患的条款。
