根据小说《银河补习班》中的描述，马飞是否已经死亡还存在很多疑问和争议。以下是我对此问题的一些分点回答：
1. 马飞消失的背景
在小说中，马飞是一个北京大学物理系的优秀学生，因为追求真理和自由而加入了民主运动并成为了学生领袖之一，在1989年天安门事件中起到了重要作用。随后，他逃离中国来到美国，但是不久之后就在纽约的一次餐厅聚会中神秘失踪。这种背景下，一些读者和评论家认为他可能已经被中国当局逮捕或刺杀，所以被认为已经死亡。
2. 小说中的描述
小说《银河补习班》是讲述马飞的生前和死后的故事，但是在整个小说中，作者并没有给出确凿的证据表明马飞是否死亡。小说中的每个章节都以一个人物的视角展开，通过他们的回忆、想象和梦境，来探究马飞这个人物的内心世界。比如，有些章节中描述马飞已经死亡，比如他的母亲梦到儿子在陶瓷棺材里；有些章节中又暗示他尚未死亡，比如双胞胎兄弟艾迪和对恩纳斯坦在异世界重逢时看到的马飞影像。
3. 不同人物的观点和解释
在小说中，不同的人物对于马飞是否死去的观点和解释也不同。比如，在银河补习班中，马飞的好友崔老师认为马飞在逃跑中可能遇到了事故，但并没有直接证明他已经死亡；而恩纳斯坦则将马飞看作是一个传说中的英雄，即使已经死去，他仍然在那个时代的人心中留下了深刻的印象。
综合来看，马飞是否已经死亡这个问题是一个明里暗里交织的谜团，小说中存在很多不确定性和想象空间。从某种意义上来说，这也是小说所要探究的一个重要主题，即历史的真相并不总是被清晰地呈现在我们面前，而需要我们通过多方面的角度来加以理解和探索。
