鲁邦三世与名侦探柯南曾经有过多次的合作，但同时也有一些穿越专门两人对决的剧集。
1. 第一次对决： 在鲁邦三世的TV SP5中，第二集和第三集是以鲁邦三世和柯南的对决为主线展开的。
2. 第二次对决： 在名侦探柯南的电影《名侦探柯南：绝海的侦探》中，鲁邦三世也出现在影片当中，两人互相追逐和偷盗的情节十分有趣。
3. 第三次对决： 在鲁邦三世的OVA中，第13集是其中一集名叫《喜欢啊喜欢！梦幻的魔术秀!!》的剧集。柯南和妃英理以及鲁邦三世和珍妮一起参加一个魔术比赛，在比赛当中两方最终还是谁也没有输赢。
值得一提的是，鲁邦三世与柯南并不是敌对关系，两位大侦探只是一个长期为了藏身而玩捉迷藏的游戏，并且两人默契程度非常高。
