地中海面积不断缩小的原因主要有以下几点：
1. 气候变化：地球气候变化导致降雨分布和蒸发量变化，进而造成水循环与水资源的分布和变化。由于地中海地区大部分地质构造是山岳环抱和沿海平原，使得雨水难以渗入地下水层，土壤和植被失去湿润的水源，导致水资源匮乏和靠海开采淡水的状况日益普遍。
2. 地质演化: 地中海区域的地壳活动频繁，尤其是地中海地区是地球板块碰撞和交汇的焦点之一。造成了地中海地区的地形变化，如海平面升高、海岸线的退缩、岛屿在合并、裂解、侵蚀等等。
3. 化工污染：地中海沿岸的大城市、重工业与航运业的污染物滥放让巨浪与昏暗之处成为人们对这片海域的印象。“地中海污染”长期存在，大量的废弃品、污水、农药、塑料垃圾、石油船(锅炉渗漏、洒落)等等，对地中海的生态环境和海洋生物的健康形成了极大的威胁，缩小了生命生存空间。
4. 过度开采: 沿岸国家为了发展经济和满足人民生活需要，过度开采资源，如淡水口岸够给不同国籍的人大量提供水源。另外，一些捕鱼者不合法垂钓，导致其中休闲用途和保护建设饰品资源被过度使用。
5. 人工干预: 地中海接近欧亚大陆，有着丰富的文化遗产，吸引了大量游客涌入这里旅游，开发了大量旅游产业，大规模的人类活动和基础设施建设带来了持续的环境破坏和生态系统破坏。
在以上原因的不断作用下，地中海的面积快速缩减，同时生态环境与海洋生物的多样性也在不断下降。
