南京火车站和高铁站不在一起，它们是两个独立的交通设施，有以下几点说明：
1.位置不同。南京火车站位于南京市玄武区仙林大学城东门，而南京南站(高铁站)则位于江苏省南京市鼓楼区将军大道南侧。
2.服务对象不同。南京火车站主要服务普通列车，而南京南站(高铁站)则主要服务高速动车和高速列车。
3.交通方式不同。南京火车站周边有多条公交线路和地铁线路可以直接到达，而南京南站(高铁站)周围交通相对不太便利，需要搭乘出租车或者公交转乘才能到达。
4.建造时间不同。南京火车站最早建成于1908年，经过多次改造已经具有近百年历史，而南京南站(高铁站)则建成于2010年，是全国最先进的高铁枢纽之一。
综上所述，南京火车站和南京南站(高铁站)不在一起，它们各自独立，因此出行时需要根据自身需求选择交通工具和目的地。
