变异的根本来源是基因突变。基因突变指的是基因发生的突然而不可逆的改变，包括点突变、大片段基因缺失或重复、染色体结构变异等。基因突变是基因遗传变异的主要形式，其产生的原因主要有以下几种：
1. 自然突变：自然环境中的一系列因素如化学物质、辐射等均会导致基因发生突变。
2. 人为突变：人类的活动也可引起基因突变，例如环境污染、辐射灾害、基因工程等。
3. 遗传性突变：家族遗传病和常染色体显性、隐性遗传等都属于遗传性突变。
4. 自修复机制失败：带有错误碱基对的DNA，如果没有被修复，就会导致基因突变。
以上是基因突变所导致的变异的根本来源。基因的突变不仅给个体自身带来变化，也将传递给后代，因此基因突变对种群进化和物种多样性具有重要影响。
