一汽大众速腾的飞轮进水问题可能会导致发动机无法正常工作，严重影响车辆行驶安全。以下是处理方法：
1.检查并更换空气滤清器：空气滤清器的损坏或堵塞可能会让进气管道中的空气含有水分，最终导致发动机进水。检查空气滤清器是否损坏或堵塞，必要时更换。
2.检查进气管道：进气管道存在断裂、破损等异常情况时，容易引起发动机进水，需要检查进气管道是否有漏洞或破损，并及时更换或维修。
3.检查火花塞：火花塞失灵或老化也可能导致进气管道中的空气产生涡流，并将水分吸入发动机内部。因此，需要检查并更换火花塞。
4.保持发动机正常运转：在高速行驶过程中，需要保证发动机正常运作，同时注意及时更换机油和冷却液，以防止水蒸汽和水结晶在发动机内积聚。
5.纠正自行修改的零部件：如果发现车辆被私自改装过零部件，需要及时纠正。私自改装的零部件可能会导致车辆不稳定或工作异常，造成发动机进水。
处理飞轮进水问题需要根据具体情况来对症处理，如果无法自行解决，建议及时联系专业的汽车维修技师进行检查和维修。同时，也要加强自身的维护意识，定期保养车辆，避免出现故障或事故。
