1. 雌蕊退化：重瓣太阳花由于基因变异，使得花朵变得复杂而美丽，但这也导致了雌蕊的萎缩和退化，从而无法正常结成种子。
2. 不孕性：部分重瓣太阳花还会产生不孕性问题。这是因为重瓣花瓣和花托内部的细胞增生过多，使得花药无法正常发育，花粉无法成熟，影响雌蕊授粉和种子的形成。
3. 人为因素：一些商家为了追求花朵的美观度，通过重复杂交等方法选育出了重瓣太阳花。然而，这些人工改良的花种常常会忽略植物天然繁衍的需要，导致无法自然结实。
4. 花期过短：由于重瓣太阳花花期时间较短，会很快过期凋谢，不利于种子的顺利结实。
5. 自交不利：虽然有些重瓣太阳花的花朵依然可以正常结实，但这些种子的基因多数都较为单一，受到疾病和环境影响的抵御能力较低，不利于整个种群的生长和发展。
