美国进行合爆袭击时，广岛、长崎两地准确的平民人口和驻军人数及劳工、俘虏人数日本官方至今没有公布。加上合爆后不久即被美军占领的历史条件，当时合爆的伤亡人数至今也没有准确的统计。
另外，根据1956年日、美联合调查团按照1945年7月（长崎）和6月31日（广岛）市民口粮供应登记得出广岛市25.5万人、长崎市17.4万人，以这一数字作为合爆时两市的总人数，调查统计结果为：广岛遭袭当天死亡4.5万人，伤9.1万人，伤亡总数13.6万人，到1945年底伤员中又有1.9万人死去，死亡总数达6.4万人。这样伤亡和死亡总数分别占全市人口的53.3％和25.1％；长崎遭袭当天死亡2.2万人，伤6.4万人，到1945年底伤员中又有1.7万人死去，死亡总数达3.9万人，这样伤亡和死亡分别占全市人口的36.8％和22.4％。
