用人单位制度规定劳动者自离扣工资20%违法。
自离，即自动离职，指劳动者根据用人单位和自身情况擅自离职，而强行解除与用人单位的劳动关系的一种行为。因辞职或要求解除合同未准，擅自离职或违约出走；未说明原因不辞而别；受优厚待遇诱惑擅自“跳槽”等均属自动离职。
自动离职属于违法解除合同，按照《劳动合同法》第九十条规定，对用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。但这种赔偿责任，应当根据劳动者自离给用人单位造成的实际经济损失确定，而非简单地规定为工资的20%。
《劳动合同法》
第九十条 劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
劳动部
《关于实行劳动合同制度若干问题的通知》
劳部发〔1996〕354号
18．职工解除劳动合同，应当严格按照《劳动法》的规定，提前三十日以书面形式向用人单位提出。职工自动离职属于违法解除劳动合同，应当按照《违反〈劳动法〉有关劳动合同规定的赔偿办法》承担赔偿责任。
