1998年，汀州镇新设商业城居委会；大同镇新设黄麻畲村委会；河田镇新设黄坑村委会。年底，长汀县辖11个镇、7个乡，9个居委会、290村委会。
汀州镇 驻水东街，辖9个居委会（西门街、南门街、五通街、水东街、营背街、西内街、中心坝、东门街、商业城）。
馆前镇 驻汀东，辖14个村（汀东、复兴、赤坑、马坪、严坊、陈莲、东庄、义家、南材、珊坑、黄湖、云丰、小洋、坪埔）。
河田镇 驻中街，辖31个村（上街、中街、下街、南塘、窑下、朱溪、游坊、芦竹、车寮、刘源、迳背、南冇、蔡坊、上修坊、根溪、中坊、马坑、伯湖、罗地、露湖、下修坊、明光、松林、晨光、寒坊、红中、半坑、南山下、余地、潘屋、黄坑）。
大同镇 驻东关营，辖30个村（师福、高坑、黄屋、荣丰、翠峰、东埔、东街、计升、李岭、红卫、草坪、红湖、印黄、天邻、东关、南里、南寨、新庄、罗坊、红星、新民、七里、利星、光明、建明、新峰、郑坊、七古、镇平、黄麻畲）
古城镇 驻古城，辖17个村（中都、古城、井头、元坑、苦竹、长塅、下增、溜下、黄泥坪、青山、梁坑、马头山、南岩、杨梅溪、元口、黄陂、丁黄）。
新桥镇 驻新桥，辖20个村（三坑口、潭复、石人、江坊、余陂、叶屋、鸳鸯、新桥、茜陂、岗头、任屋、牛岗、湖口、石槽、廖家、罗坑、樟树下、新店、李家、刘坊）。
童坊镇 驻后龙山，辖24个村（赖屋、青潭、童坊、胡岭、长坝、新畲、林田、横坑、别哩、举林、举河、双桥、下坑、肖岭、马罗、大埔、彭坊、红明、龙坊、葛坪、长春、黄坊、禾生、刘陈）。
南山镇 驻南山，辖21个村（大坪、南田迳、南山、严婆田、大田、大坑、谢屋、洋背、朱坊、廖坊、连屋岗、邓坊、桥下、黄家庄、蔡屋、中复、长窠头、官坊、五抗、塘背、杨谢）。
濯田镇 驻街上，辖40个村（街上、坝尾、中坊、上庙、下洋、巷头、山田、龙田、横田、安仁、李湖、长高、丰口、左拔、升平、水头、羊赤、寨头、莲湖、陈屋、路潭、南安、永巫、梅迳、长兰、美西、园当、塍背、湖头、段上、河东、长巫、刘坊、刘坑头、美溪、水口、同睦、东山、上塘、刘坑）
四都镇 驻同仁，辖18个村（楼子坝、荣坑、溪口、上蕉、渔溪、新华、红都、同仁、圭田、坪埔、关牯岭、汤屋、红寮、上湖、小金、琉璃、下坪、谢坊）。
涂坊镇 驻涂坊，辖15个村（迳口、马屋、赖坊、涂坊、红坊、溪源、河甫、慈坑、邱坑、洋坑、罗屋岗、元坑、中华、吴坑、扁岭）。
三洲乡 驻三洲，辖8个村（小潭、曾坊、丘坊、兰坊、三洲、小溪头、桐坝、戴坊）。
策武乡 驻策田，辖14个村（策田、策星、林田、当坑、高田、红江、德联、陈坊、河梁、李城、李田、南坑、南溪、黄馆）。
铁长乡 驻铁长，辖4个村（铁长、芦地、张地、洋坊）。
庵杰乡 驻庵杰，辖5个村（庵杰、涵前、上赤、黄坑、长科）。
宣成乡 驻寨背，辖8个村（长桥、畲心、寨背、下畲、兰田、泮溪、溪源、中畲）。
红山乡 驻腊口，辖11个村（腊溪、中坪、苏竹、元岭、童上、红冇、苏陂、山阳、山车、赤土、上坪）
羊牯乡 驻羊牯，辖10个村（羊牯、对畔、吉坑、罗坑头、白头、官坑、余家地、周家地、百坪、百丈）。
2000年，策武乡政府驻地从策田村迁移到德连村。2000年底，长汀县辖11镇7乡：汀州镇、馆前镇、河田镇、大同镇、古城镇、新桥镇、童坊镇、南山镇、濯田镇、四都镇、涂坊镇、三州乡、策武乡、铁长乡、庵杰乡、宣成乡、红山乡、羊牯乡。 根据第五次人口普查数据：全县总人口403121人，其中： 汀州镇 55780 大同镇 47178 古城镇 14215 新桥镇 23444 馆前镇 14009 童坊镇 22719 河田镇 50926 南山镇 31903 濯田镇 39803 四都镇 13865 涂坊镇 20694 策武乡 21608 铁长乡 4708 庵杰乡 7203 三洲乡 10646 宣成乡 9070 红山乡 7841人、羊牯乡 7509人
2003年，长汀县辖11个镇、7个乡：汀州镇、馆前镇、河田镇、大同镇、古城镇、新桥镇、童坊镇、南山镇、濯田镇、四都镇、涂坊镇、三洲乡、策武乡、铁长乡、庵杰乡、宣成乡、红山乡、羊牯乡。2003年末，户籍人口49.24万人，其中非农业人口14.01万人。
2005年，长汀县辖11个镇、7个乡：汀州镇、馆前镇、河田镇、大同镇、古城镇、新桥镇、童坊镇、南山镇、濯田镇、四都镇、涂坊镇、三洲乡、策武乡、铁长乡、庵杰乡、宣成乡、红山乡、羊牯乡。
