根据不同分类交税。
增值税是针对应税行为征收的间接税，纳税人如何缴纳增值税，取决于其具体的增值税应税行为。财政部税政司《关于财税[2016]140号文件部分条款的政策解读》也明确规定“应根据取得收益的性质，判断其是否发生增值税应税行为，并应按现行规定缴纳增值税”。
根据《营业税改征增值税试点实施办法》对于“金融服务”的分类，私募基金增值税应税行为主要表现为：
（1）贷款服务
私募基金将资金贷与他人使用而取得利息收入，包括金融商品持有期间（含到期）利息（保本收益、报酬、资金占用费、补偿金等）收入、买入返售金融商品利息收入等，均需按照“贷款服务”缴纳增值税。
其中，上述的“保本收益、报酬、资金占用费、补偿金等”系指合同中明确承诺到期本金可全部收回的投资收益。
换而言之，如果私募基金投资于银行委贷、企业债券等取得的利息或具有利息性质的收入，应当缴纳增值税。考虑到私募基金管理人就“贷款服务”可取得的进项税抵扣有限，财税[2017]56号文之“按照3%的征收率缴纳增值税”的规定，实质上降低了“贷款服务”增值税税负。
需要提醒的是，根据《营业税改征增值税试点过渡政策的规定》，私募基金因投资国债、地方政府债取得的利息收入免征增值税。
（2）金融商品转让
根据《营业税改征增值税试点过渡政策的规定》规定，证券投资基金（封闭式证券投资基金，开放式证券投资基金）管理人运用基金买卖股票、债券取得的金融商品转让收入，免征收增值税。
鉴于《证券投资基金法》已经明确将私募基金纳入证券投资基金范畴，私募基金买卖股票、债券取得的金融商品转让收入，同样适用上述免征增值税优惠政策。
至于私募基金因买卖外汇、非货物期货等其他金融商品取得金融商品转让收入，则应当按照财税[2017]56号文计征增值税。
当然，私募基金在持有股票期间，可能会取得股票分红。由于股票分红不属于保本性收益，根据财税〔2016〕140号文，该等股票分红不属于增值税征税范畴。
扩展资料
注：这里假设增值税附加=应纳税额×12%。实践中各地增值税附加率会有所不同。
（一）契约型私募基金A当期收到基金管理费50万元（无进项税额）。另外当期买卖公司债，买入价1000万元，卖出价1100万元。期间收到公司债利息50万元，另收到所持有国债利息30万元。
【1.管理费】
50万元为直接收费金融服务销售额，按照一般计税方法，6%税率计算应纳税额。
应纳税额=[含税销售额÷（1+税率）×税率-当期进项税额] ×（1+增值税附加税率）
=[50÷（1+6%）×6%－0] ×（1+12%）
约3.17万
纳税主体：该契约型基金的管理人。
【2.债券买卖价差】
1100-1000=100万元为该金融商品转让行为的销售额，按照简易计税方法，3%征收率计算应纳税额。
应纳税额=含税销售额÷（1＋征收率）×征收率×（1+增值税附加税率）
=100W÷（1+3%）×3% ×（1+12%）
约3.26万
纳税主体：该契约型私募基金的管理人。
【3.债券利息】
企业债利息50万元为贷款服务的销售额，国债利息收入免税。按照简易计税方法，3%征收率计算应纳税额。
应纳税额=含税销售额÷（1＋征收率）×征收率×（1+增值税附加税率）
=50W÷（1+3%）×3% ×（1+12%）
约1.63万
纳税主体：该契约型私募基金的管理人。
（二）有限合伙型私募基金当期买卖地方政府债，买入价500万元，卖出价502万元。该有限合伙企业为一般纳税人。
【债券买卖价差】
502-500=2万元为该金融商品转让行为的销售额。本案例应按照一般计税方法6%税率计算应纳税额。
应纳税额=[含税销售额÷（1＋税率）×税率-当期进项税额]×（1+增值税附加税率）
=[20000÷（1+6%）×6%-0] ×（1+12%）
约1267.92元
纳税主体：该有限合伙企业。
参考资料来源：百度百科-增值税
参考资料来源：百度百科-营业税改征增值税试点实施办法
