1、公司会无法开发票，因为需要重新领购时税务局会要求更换税字号，需要重新刻制发票专用章，换领新发票；
2、公司本身正常在报税，已经有报税的数字证书，有可能会因为这个三证合一的事情导致密码无法登陆，需要到前台重置。
扩展资料
三证合一”的效果是化繁为简，降低行政成本，提高企业创业活力，鼓励投资，降低交易成本。结束了过去工商登记信息，质监局组织机构代码，税务局税务信息之间的孤岛现象，这样就为下一步全国范围内的信用信息整合打下基础。
“一照一码”改革后，商事主体可凭借标注了统一社会信用代码的营业执照，在政府机关、金融机构等部门证明其主体身份和办理相关业务；公众可通过统一社会信用代码在政府和其他信用信息公示平台上查询商事主体的信用信息；
社会各界都可以利用统一社会信用代码实现信息共享、数据挖掘和业务协同。尤其对政府管理部门来说，以统一社会信用代码为唯一标识建立并关联商事主体的相关信用信息，可与公民身份证一起实现“两码管两人”（自然人和法人），
拓宽商事主体信用信息的征信范围，实现信用监督的信息化和便利化，来提升社会管理的效能。在法人和其他组织违法违规和失信惩戒机制的逐渐健全完善后，可真正意义上实现“一处违法，处处受限”，促进社会信用体系建设。
“三证合一”给市场主体更便捷的服务，这是业内一直在呼吁推动的改革，也是市场经济发达国家通行的做法，特别是在信息化社会中，就应该更简化。
参考资料来源：百度百科-三证合一
