全国企业信用信息公示系统不能查询事业单位。
全国企业信用信息只能查询全国的企业相关信息，如果想查询事业单位的信息可以通过组织机构代码来查询，因为组代包含全国的企事业单位社会团体和各种组织的信息。
企业单位一般是自负盈亏的生产性单位。所谓“自负盈亏”意即：自己承担亏损与盈利的后果，有一定的自主权。企业单位分为国企和私企。国企就是属国家所有的企业单位。私企就是属个人所有的企业单位。
事业单位一般是国家设置的带有一定的公益性质的机构，但不属于政府机构，与公务员是不同的。一般情况下国家会对这些事业单位予以财政补助。分为全额拨款事业单位，如学校等，差额拨款事业单位，如医院等，还有一种是自主事业单位，是国家不拨款的事业单位。
