我升高中的时候没把初中的团籍转到高中，那我还算团员吗

呵呵，傻孩子！是否是团圆对高考没有任何影响，相反到大学里，人家不在乎你是不是团员，更在乎您是不是党员，还有入党 和是否是团员没有关系，因为到大学你基本上也到了改退团的年龄了。
还有团员证丢了，不代表你就脱离团关系了，只要你交了团费。团关系还在你们学校的团委里呢。如果你初升高 是同一所学校那倒无所谓，要是不在一所学校的话，那不知你有没有转团关系？应该有老师专门负责给你们的啊。要是没转或许还在你原校，你去你初中学校团委问问就行了。还有，你们班的团支书不称职啊，呵呵~~